Остроконечные кондиломы влагалища похожие на те, которые развиваются на вульве и шейке матки, хотя для влагалища более характерны плоские кондиломы. Экзофитные кондиломы обычно оказываются в нижней части влагалища, в ассоциации с кондиломами вульвы или в верхней части влагалища в ассоциации с кондиломами шейки матки.
Возбудителем заболевания является ВПЧ, онкогенный субтип которого считают этиологическим фактором вагинальной интраэпителиальной неоплазии (VaIN), подобной к интраэпителиальной неоплазии вульвы (VIN) и шейки матки (CIN).
Микроскопическое исследование остроконечных кондилом влагалища: выявляются папиллярные выросты, поддерживаемые нежной фиброзной тканью. Кератинизации обычно не наблюдается.