Неороговевающий плоскоклеточный рак шейки матки характеризуется отсутствием «перлов», хотя некоторые клетки могут иметь признаки кератинизации. Раковые клетки являются преимущественно крупными, но значительно варьируют по размеру и форме. Они обычно собраны в «гнезда», имеют нечеткие клеточные границы, круглые или овальные ядра с крупнозернистым хроматином и высокий митотический индекс.
Ороговевающий плоскоклеточный рак шейки матки содержит кератиновые «перлы». Признаки кератинизации преимущественно имеют большие аномальные эпителиальные клетки с высокой степенью плеоморфизма. Опухолевые клетки, собранные в «гнезда» или широкие полосы, имеют более неровные контуры, чем при ороговевающем раке, эозинофильную цитоплазму, ядра разных размеров, четкие клеточные границы. Митотических фигур меньше, чем при неороговевающем раке.