Интестинальные пограничные муцинозные опухоли яичников не имеют сосочков или сосочки являются короткими или нитевидными. Кисты и сосочки выстланы эпителием с вариабельным количеством бокаловидных и других клеток интестинального типа. Эпителий варьирует от атипичного к карциноматозному (интестинальные пограничные муцинозные опухоли яичников с интраэпителиальной карциномой).
Интенсивной стромальной инвазии нет при обоих типах интестинальных муцинозных пограничных опухолях яичников, но может случаться микроинвазия (каждый фокус инвазии менее 10 мм2). В этом случае имеется микроинвазивная интестинальная муцинозная пограничная опухоль яичников с интраэпителиальной карциномой.
Строма может быть десмопластичной, экстенсивно инфильтрированной воспалительными клетками; может напоминать овариальную строму и содержать группы лютеинизованных клеток. Доброкачественные и пограничные зоны часто сосуществуют. Интенсивная стромальная инвазия часто связана с наличием интраэпителиального карциноматозного компонента.
Степени дифференциации муцинозных опухолей разработала группа гинекологических онкологов.